Центр турецкой культуры имени Юнуса Эмре был открыт при Бакинском государственном университете в соответствии с договором, подписанным 13 сентября 2012 года между БГУ и Институтом Юнуса Эмре. Это стало возможным благодаря соглашению о сотрудничестве между Президентом Азербайджана Ильхамом Алиевым и премьер-министром Турции Реджеп Таип Эрдоганом.
Центр турецкой культуры имени Юнуса Эмре непосредственно связан с Фондом и Институтом, носящими имя одного из классиков турецкой поэзии – Юнуса Эмре. Фонд и Институт были созданы 5 мая 2007 года по инициативе президента Турецкой Республики А. Гюля, который также является председателем Почетного совета Фонда. Министр иностранных дел Турции Ахмед Давудоглу, в свою очередь, возглавляет Попечительский совет Фонда. Фонд создан с целью продвижения турецкого языка, культуры и усиления межкультурных связей. Фонд Юнуса Эмре уделяет особое внимание изучению турецкого языка.
Институт Юнуса Эмре, наряду с преподавательской и учебной деятельности, реализовывает различные научно-исследовательские проекты. С целью пропаганды турецкой культуры, истории, языка и литературы Институт проводит различные исследовательские работы, налаживает сотрудничество со структурами, которые могут оказать эффективное содействие этим научно-исследовательским проектами и с помощью СМИ знакомит общественность с результатами этих исследований.
Центр турецкой культуры имени Юнуса Эмре при Бакинском государственном университете при поддержке Управления по делам турок, проживающих за рубежом и родственных народов ежегодно организовывает летние школы по изучению турецкого языка в Турции для азербайджанских студентов.
В рамках этого проекта студенты получают возможность не только изучать турецкий язык, но и принимать участие в культурных поездках по различным регионам Турции. Программа бесплатная, студентам выплачивается стипендия в размере 250 долларов.
Действующий при содействии Турецкого агентства развития и сотрудничества (TİKA) Центр турецкой культуры имени Юнуса Эмре расположен в 1-ом учебном корпусе БГУ. Глава центра Али Джура.