Elmi fəaliyyətin təşkili və innovasiyalar Mərkəzinin tərkibində 5 şöbə fəaliyyət göstərir:

ELMİ-TƏDQİQATLARIN TƏŞKİLİ VƏ TƏHLİLİ ŞÖBƏSİ

ELMİ-TƏŞKİLATİ ŞÖBƏ

TEXNOLOGİYALARIN TRANSFERİ VƏ İNNOVASİYALAR ŞÖBƏSİ

MAGİSTRATURA VƏ DOKTORANTURA ŞÖBƏSİ

ƏQLİ MÜLKİYYƏTİN QORUNMASI ŞÖBƏSİ